学校于2023年6月成立卓越工程师学院，学院定位为服务国家重大战略需求，集产学研创为一体，面向战略性新兴产业的流程工业科技创新的独立实体平台。秉承“二元培养互鉴互促、学科交叉对接产业、机制创新产教融合、攻关牵引科教融汇”四大理念，通过“布局全链条、聚合全要素、监控全过程”的校企联合和国际合作，探索形成学科优势明显、国际化特征显著的工科高校工程教育改革新范式。

学院建设目标是培养一大批创新型卓越工程师。面向国家重大战略急需关键核心领域，培养一大批掌握流程工业科技坚实宽广的基础理论和系统深入的专门知识，具备全球战略视野，突出工程技术创新能力、动态适应能力、未来科技引领能力，善于解决复杂工程技术问题和“卡脖子”问题的高素质、高层次、交叉复合的创新型卓越工程师。

聚焦战略性新兴产业中的流程工业科技人才培养。依托学校化学工程优势学科集群和发展布局，面向集成电路、生物医药、人工智能、先进材料、绿色能源、高端装备六大领域，分别培养产业攻关急需的电子化学品、生物化工、流程控制、化工新材料、氢能、储能、煤化工、盐化工、智能传感与物联等“高精尖缺”人才。

卓越工程师学院与中国石油天然气集团、上海电气集团、华虹集团、苏州工业园区等近30家央企、地方龙头企业、关键领域企业、地方新兴产业园区合作，开展国内项目培养。每年招收工程硕博士培养改革专项80人左右、博士研究生先进技术联合培养专项40人左右、独立自建产教融合工程硕博士专项100人左右。